Molekulární fylogenetika, KZO/593 |
Informace ve studijní informačním systému STAG Garant kurzu:- prof. RNDr. Václav Hypša, CSc. Vyučující kurzu:- prof. RNDr. Václav Hypša, CSc. Sylabus:Obsah přednášek:Specifika molekulárně biologických dat, jejich výhody a nevýhody. Získávání molekulárně biologických dat pro účely systematiky (sekvenování, RFLP, RAPD, AFLP, alozymy, mikrosatelity, SSCP, reasociační analýza, imunologické metody, proteinový fingerprinting). Zpracovávání získaných dat - fenetické a kladistické přístupy, distanční a znaková data, metody výpočtu distancí na základě různých typů znakových dat, konstrukce dendrogramů, UPGMA, NJ, ML, ME, porovnávání dvou dendrogramů, testování spolehlivosti jednotlivých větví dendrogramů (jackknifing, OUT-jakknifing, bootstrapping). Biologická interpretace výsledků. Získávání programů pro molekulární fylogenetiku. Obsah cvičení:Procvičování probrané látky na počítačích Doporučená literatura:- D. Graur, W. H. Li Fundamentals of Molecular Evolution. Sunderland Massachusetts, 1999. - D. M. Hillis, C. Moritz and B. K. Mable Molecular Systematics. Sinauer Assocites, Inc., Sunderland Massachusetts, 1996. - Další materiály (včetně obrázků) jsou také na adrese http://www.natur.cuni.cz/flegr/. - J. C. Avise Molecular Markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, New York, 1993. - W. H. Li Molecular Evolution. Sinauer Assocites, Inc., Sunderland Massachusetts, 1997. |